2009年6月23日，科技部基礎(chǔ)研究管理中心在北京組織召開蛋白質(zhì)組學(xué)國家重點實驗室(軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院)的驗收會議。實驗室驗收專家組由9位國內(nèi)知名專家組成，組長為中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院的沈巖院士。科技部基礎(chǔ)研究管理中心劉燕美副主任，總后勤部衛(wèi)生部科訓(xùn)局黃殿龍副局長、科技部基礎(chǔ)研究司基地建設(shè)處周文能處長等出席會議并講話。
  驗收專家組認(rèn)真審閱了實驗室的建設(shè)計劃任務(wù)書和建設(shè)驗收申請報告，并通過聽取實驗室建設(shè)報告、現(xiàn)場考察、與實驗室固定人員座談等方式考察實驗室的建設(shè)情況。一致認(rèn)為，蛋白質(zhì)組學(xué)國家重點實驗室自2007年10月批準(zhǔn)建設(shè)以來，結(jié)合國家需求與學(xué)科發(fā)展，開展了深入的基礎(chǔ)及應(yīng)用基礎(chǔ)研究。凝煉形成了“人類肝臟蛋白質(zhì)組組成及其功能網(wǎng)絡(luò)研究”等研究方向。
  實驗室在建設(shè)期間，科研成果突出，在蛋白質(zhì)組新技術(shù)新方法、重要蛋白質(zhì)功能研究、重大疾病分子標(biāo)志物篩選驗證等方面取得了具有國際影響的研究成果，發(fā)表了一批高水平學(xué)術(shù)論文。獲得國家自然科學(xué)獎二等獎、國家科技進步獎二等獎等4項獎勵。
  實驗室隊伍規(guī)模和年齡結(jié)構(gòu)合理，現(xiàn)有科學(xué)院院士1人，國家杰出青年基金獲得者4人，并培養(yǎng)和引進了一批年輕的學(xué)術(shù)帶頭人和科研骨干，在隊伍建設(shè)和人才培養(yǎng)方面取得了顯著成效。
  建設(shè)期間，實驗室健全與完善了各種規(guī)章制度，逐漸實現(xiàn)管理制度化。開展了廣泛的國內(nèi)外學(xué)術(shù)交流，積極參與多項大型國際科技合作計劃，舉辦了3次國際、2次國內(nèi)學(xué)術(shù)會議。
  驗收專家組認(rèn)為，實驗室全面完成建設(shè)計劃任務(wù)書中所規(guī)定的各項任務(wù).